“第五研究所”内。爱德与No.66铠甲男激烈的打斗着。爱德一刀斩开了对方密封的头盔，却愕然发现，在盔甲内部竟然有着和阿尔一样的血印。No.66铠甲男冷笑着道出了原由。原来，第五研究所与临近的处决犯人的监狱有着密切的联系，而犯人们则成为了军方的实验品。至于作为敌对的这位铠甲男也不过是本该在两年前就被处决的死刑犯。而爱德也在对方以为自己没有了弱点的同时揭开了不死之身的迷题。“连接着灵魂的血印就是身体的弱点，只要把它破坏了，一切都将结束”。
    阿姆斯特朗少佐来到了艾尔林克兄弟的栖身之地探访二人，不料住所已经被斯卡破坏的不成样子。当从罗斯少尉口中得知兄弟二人已经去了“第五研究所”颇为恼火，决定带领士兵前去支援。
    第五研究所内，爱德由于机械臂出了故障（此时，还在家乡的温莉发现了工作桌上的螺丝，“哎？这该不是给爱德安装义肢时落下的吧”...这个马虎的温莉，你想害死爱德呀！）使得战斗呈现了一边倒的局面。在体力不支的情况下，爱德运用空隙，把石头炼成了阿尔的模样，迷惑了No.66，并利用破绽一刀斩落了头盔。对方虽然血印没给破坏掉，但已经没有了还手之力了。哪知在套问对方口供的同时，倒在一旁的身体却自己站了起来，并给了没有防备的爱德已重创。原来，所谓的No.66竟然是兄弟两人。已被打败的头部是哥哥，而身体则是弟弟。爱德失血过多使得意识渐渐的模糊，被逼到角落的他瞬间领悟到了斯卡所使用过的炼金术的分解步骤。一发逆转了局势，击败了对方。而对方则毫不在乎的要求爱德了结自己那已经不能被称为“人”的生命，爱德陷入了困惑中。“如果我承认你们不是人类的话，那我就不得不承认我的弟弟...”
    与此同时，第无研究所的门口。阿尔轻松的应对着No.48铠甲男。当得知对方竟然就是当年欲谋害爱德的那为屠宰场的老板巴利，而今本应该早已被处决的他竟然被变成了于自己一样的人，不禁疑惑了起来。而对方也信口的迷惑着阿尔。道出了哥哥对你的爱不过是虚假的、而记忆则只是炼成的碎片之类的话。则使的阿尔越发的困顿。前所未有的悲哀气氛笼罩在第五研究所的上空。神秘的夜幕下在”我是阿尔丰斯，艾尔林克”的声音中显得是那么的寂静...